注: 任務不要重復多次提交,一次建議只運行一個主流程任務,多任務并行會導致卡頓,以至運行失敗。一般正常任務 一天之內(nèi)能夠分析完成,如一天之后還沒運行完成,可能就是任務失敗了,需要聯(lián)系后臺人員查看報錯原因處理。
]]>進入項目管理 – 我的項目 – 打開對應的項目
上述報告查找頁面 – 打開報告之后 – 點擊報告右上角 – 項目結(jié)果下載 – 選擇下載結(jié)果數(shù)據(jù)
結(jié)果數(shù)據(jù)較小的直接使用瀏覽器下載,較大的需要使用 ftp 下載,具體的 ftp下載指導在后續(xù)詳細介紹。
我們對于不同的產(chǎn)品對應了不同的編號加以區(qū)分,詳細如下:
報告/任務編號對應產(chǎn)品類型:
微生物多樣性:microbial_年月日編號
微生物多樣性更新報告:Microbial_updateReport_年月日編號
無宿主宏基因組:MetaG_年月日編號
有宿主宏基因組:MetaG_宿主拉丁名_年月日編號
宏基因組更新報告:metag_updateReport_年月日編號
微生物基因組:MicroG_年月日編號數(shù)據(jù)下載:上述報告查找頁面 – 點擊左側(cè)數(shù)據(jù) – 進入相應數(shù)據(jù)文件夾
進入 microbial_*(或者其他產(chǎn)品類型對應的編號)對應的文件夾下 – 打開Needed_Data 文件夾,具體需要下載的文件如下:
打開原始數(shù)據(jù)文件夾
目前平臺不支持文件夾下載,所以需要打開相應文件夾,全選數(shù)據(jù)后進行打包下載。
FTP 下載指導:下載方式選擇 FTP 下載,平臺會將具體的操作步驟發(fā)到注冊郵箱賬號中,也會發(fā)到個人中心信息中,如下:
打開 FTP 客戶端:依次填寫好上述主機,用戶名,密碼,端口信息,打開之后選擇最新的文件夾,里面就是剛剛選中打包下載的數(shù)據(jù),然后直接選中數(shù)據(jù),拖拽到左邊目標文件夾中即可。
建庫測序分析產(chǎn)品以結(jié)題報告的形式交給老師,報告中的分組以老師提供的分析方案為準。老師們在拿到結(jié)果后,可能會有更改樣本名、重新分組、變更聚類參數(shù)、與其他同類型項目合并分析等需求。其中,更改樣本名、重新分組、過濾物種或抽平可以通過更新結(jié)題報告實現(xiàn)(見更新結(jié)題報告操作指導),而改變質(zhì)控參數(shù)、添加更多樣本則需要重新投遞主流程(見 APP 主流程投遞操作指導)。
由于原始數(shù)據(jù)為線下交付,不再自動備份至云平臺,因此投遞主流程需要老師先將原始數(shù)據(jù)上傳至云平臺。本指導即為針對此需求撰寫的云平臺操作指南。
另:主流程分析權(quán)限(標準套餐)每項目一年售后期內(nèi)可以免費開通 3 次,一次 10天,在權(quán)限時間內(nèi)沒有分析次數(shù)限制,但是一次只能投遞一個任務。
1、登陸賬號后,在主頁面查看項目管理,進入“我的數(shù)據(jù)”
2、在我的數(shù)據(jù)中,建議新建文件夾后,進入新文件夾,點擊“上傳”,選擇上傳文件或 FTP 上傳。
上傳文件:選 擇 文 件 上 傳 , 點 擊 “ 上 傳 ” , 選 擇 下 載 好 的 原 始 數(shù) 據(jù)(\Needed_Data\Rawdata\01.Rawdata 路徑下的所有文件),點擊確定即可等待數(shù)據(jù)上傳完成。
網(wǎng)頁只能上傳 200MB 以下的數(shù)據(jù),上傳更大的數(shù)據(jù)請點擊”FTP 上傳”。注:不支持上傳 0 字節(jié)文件!文件名不能包含中文及特殊字符!
FTP 上傳:數(shù)據(jù)量大于 200M 時使用 FTP 上傳數(shù)據(jù)。選擇“FTP 上傳”后彈出提示對話框,點擊“確定”后系統(tǒng)會自動創(chuàng)建一次性的 FTP 賬戶,用于本次數(shù)據(jù)上傳。賬戶信息會發(fā)送至注冊郵箱及平臺的“個人中心——消息中心”中。依照提示操作即可。
注:數(shù)據(jù)上傳完成后需要通過中轉(zhuǎn)站中轉(zhuǎn),不會立刻顯示在平臺中。具體時間視數(shù)據(jù)量而定,最久約半天時間,若仍找不到數(shù)據(jù)請聯(lián)系售后人員處理。
1、私有云平臺主頁
2、分析平臺參數(shù)頁面
3、在線查看分析報告
4、個性化分析功能展示
為滿足中小課題組的生信分析需求,百邁客推出輕量版私有云:將生信分析平臺部署在一臺高性能工作站上,實現(xiàn)開箱即用,作為百邁客私有云的有力補充。
為解決大家在Linux操作系統(tǒng)中,安裝和使用生信軟件時遇到的種種問題,百邁客全面升級了專用機搭載的軟件功能,我們的優(yōu)勢:
1)硬件:根據(jù)用戶的計算需求,我們可以提供從工作站到機架式服務器的各種硬件配置,且可以根據(jù)您的計算類型,合理配置CPU數(shù)目和內(nèi)存大小,實現(xiàn)硬件資源的組合。
2)軟件:根據(jù)用戶需求我們提供了常用生信軟件,并封裝和串聯(lián)成常用分析模塊,通過單行命令即可完成很多常規(guī)分析內(nèi)容,如基因表達量計算、突變檢測、基因功能注釋等。
部分可部署生信模塊如下:
三大產(chǎn)品形態(tài),覆蓋生信數(shù)據(jù)分析場景,
總有一款適合您!