前沿 | NEW ENGL J MED（IF=79.258）宏基因組測(cè)序輔助腦膜炎和腦炎臨床診斷

【出發(fā)點(diǎn)】

腦脊液（CSF）的宏基因組測(cè)序（NGS）具有在單次測(cè)試中鑒定多種病原體的潛力。

【方法】

在一項(xiàng)為期1年的多中心前瞻性研究中，作者團(tuán)隊(duì)研究了CSF的宏基因組測(cè)序在住院患者中診斷傳染性腦膜炎和腦炎的有效性。通過(guò)正交實(shí)驗(yàn)室測(cè)試證實(shí)了對(duì)宏基因組測(cè)序后病原體的所有陽(yáng)性測(cè)試。通過(guò)與臨床微生物測(cè)序委員會(huì)的電話會(huì)議和調(diào)查引發(fā)醫(yī)師反饋。通過(guò)回顧性圖表評(píng)估評(píng)估臨床效果。

【結(jié)果】

作者團(tuán)隊(duì)在8家醫(yī)院招募了204名兒科和成人患者?；颊卟∏閲?yán)重：48.5％的患者入住重癥監(jiān)護(hù)室，所有研究患者中30天死亡率為11.3％。 57名患者（27.9％）共診斷出58種神經(jīng)系統(tǒng)感染。在這58種感染中，宏基因組測(cè)序結(jié)果發(fā)現(xiàn)13種（22％）未在源醫(yī)院通過(guò)臨床試驗(yàn)確定。在剩余的45種感染（78％）中，19種在傳統(tǒng)檢測(cè)和宏基因組測(cè)序結(jié)果中同時(shí)進(jìn)行了診斷。在未通過(guò)宏基因組鑒定的26種感染中，11種僅通過(guò)血清學(xué)檢測(cè)確診，7種通過(guò)CSF以外的組織樣本診斷，8種由于CSF中的病原體滴度低為陰性。僅由宏基因組測(cè)序結(jié)果診斷13種中，8個(gè)可能具有臨床效果，13種中7個(gè)用于指導(dǎo)治療。

【結(jié)論】

常規(guī)微生物檢測(cè)通常不足以檢測(cè)所有神經(jīng)侵襲性病原體。在這項(xiàng)研究中，從腦膜炎或腦炎患者獲得的腦脊液的宏基因組測(cè)序改善了神經(jīng)系統(tǒng)感染的診斷，并在某些情況下提供了可操作的信息。