群體遺傳分析平臺(tái)有哪些？BSA/遺傳圖譜/GWAS/遺傳進(jìn)化云平臺(tái)推薦

群體遺傳分析平臺(tái)推薦1、全基因組重測(cè)序分析平臺(tái)

全基因組重測(cè)序是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的二代或三代基因組測(cè)序，并在此基礎(chǔ)上對(duì)個(gè)體或者群體進(jìn)行變異檢測(cè)分析。利用百邁客全基因組重測(cè)序分析云平臺(tái)，只需要上傳原始data，打開(kāi)主流程APP，即可完成從原始數(shù)據(jù)到結(jié)題報(bào)告的轉(zhuǎn)化。不僅可以下載結(jié)果，而且可以在云平臺(tái)上面做云個(gè)性化分析，不僅可以在線查看位點(diǎn)SNP、InDel、SV、CNV等信息，還可以支持設(shè)計(jì)引物、進(jìn)化樹(shù)分析等功能。

群體遺傳分析平臺(tái)推薦2、BSA分析平臺(tái)

BSA（Bulked segregant analysis）作為一種快速的性狀定位分析方法，可以極大地降低研究的工作量和成本，該方法主要是選擇雙親群體分離后代中具有極端表型的個(gè)體進(jìn)行混樣，通過(guò)比較不同極端混樣池之間的多態(tài)性標(biāo)記的差異，從而篩選出與性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因的定位。百邁客BSA分析云平臺(tái)現(xiàn)已正式實(shí)現(xiàn)云交付，可以提供BSA分析云服務(wù)，實(shí)現(xiàn)原始數(shù)據(jù)一步上傳，分析參數(shù)自主設(shè)置，除此之外，BSA分析云平臺(tái)還提供常見(jiàn)個(gè)性化分析等服務(wù)。將助力BSA成為更快速、更低價(jià)、性?xún)r(jià)比更高的性狀定位分析！

群體遺傳分析平臺(tái)推薦3、全基因組關(guān)聯(lián)分析平臺(tái)

全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome wide association study，GWAS）是對(duì)多個(gè)個(gè)體在全基因組范圍的遺傳變異（標(biāo)記）多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)，獲得基因型，進(jìn)而將基因型與可觀測(cè)的性狀，即表型，進(jìn)行群體水平的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，根據(jù)統(tǒng)計(jì)量或顯著性p 值篩選出最有可能影響該性狀的遺傳變異（標(biāo)記），挖掘與性狀變異相關(guān)的基因。全基因組關(guān)聯(lián)分析云平臺(tái)只需要提供常規(guī)的基因型文件（VCF文件）和需要分析的表型數(shù)據(jù)，即可得到多個(gè)模型的定位結(jié)果。APP中自嵌合了親緣關(guān)系分析，群體結(jié)構(gòu)（固定效應(yīng)）、場(chǎng)次、性別、批次等因素可以通過(guò)協(xié)方差文件傳入。即可拿到分析的曼哈頓圖和QQ圖，以及對(duì)應(yīng)的注釋區(qū)間。

群體遺傳分析平臺(tái)推薦4、遺傳進(jìn)化分析平臺(tái)

群體遺傳進(jìn)化是研究群體的遺傳結(jié)構(gòu)及其變化規(guī)律。其應(yīng)用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)方法研究群體中基因頻率和基因型頻率以及影響這些頻率的選擇效應(yīng)和突變作用，研究遷移和遺傳漂變等與遺傳結(jié)構(gòu)的關(guān)系。該分析平臺(tái)目前只需要提供基因型文件（VCF格式）和分組信息。即可完成遺傳進(jìn)化分析。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)、PCA、遺傳多樣性分析、群體結(jié)構(gòu)、親緣關(guān)系、LD、選擇性清除等即可一鍵獲得結(jié)果文件。

群體遺傳分析平臺(tái)推薦5、遺傳圖譜分析平臺(tái)

遺傳圖譜（Genetic map），是基于全基因組重測(cè)序技術(shù)或簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)，對(duì)某物種家系樣本進(jìn)行測(cè)序，利用生物信息學(xué)方法，開(kāi)發(fā)SNP分子標(biāo)記，計(jì)算標(biāo)記間的遺傳連鎖距離，繪制高密度遺傳圖譜。利用遺傳圖譜，可以用來(lái)進(jìn)行性狀QTL定位。該分析平臺(tái)，可以可輕松實(shí)現(xiàn)遺傳圖譜的構(gòu)建。

目前百邁客群體遺傳相關(guān)項(xiàng)目已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了云交付。百邁客云分析平臺(tái)整合了目前最主流的分析流程，結(jié)果準(zhǔn)確有保證，分析過(guò)程簡(jiǎn)單易上手，從數(shù)據(jù)上傳到參數(shù)設(shè)置，再到基因組選擇，只需簡(jiǎn)單幾步就可以完成項(xiàng)目數(shù)據(jù)的投遞和分析；結(jié)題報(bào)告云交付，分析完成即可拿到項(xiàng)目結(jié)果。
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百邁客自成立以來(lái)，深耕群體遺傳研究領(lǐng)域，在群體遺傳進(jìn)化及性狀定位方面積累了大量的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，研究物種數(shù)百種，定位性狀上萬(wàn)個(gè)，發(fā)表文章數(shù)百篇，累計(jì)影響因子2300+；極大促進(jìn)了我國(guó)群體遺傳研究的發(fā)展。

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